Environmental DNA metabarcoding elucidates patterns of fish colonisation and co-occurrences with amphibians in temperate wetlands created for biodiversity

Simple item page
dc.contributor.authorIneta Kačergytė
dc.contributor.authorErik Petersson
dc.contributor.authorDebora Arlt
dc.contributor.authorMicaela Hellström
dc.contributor.authorJonas Knape
dc.contributor.authorJohan Spens
dc.contributor.authorMichał Żmihorski
dc.contributor.authorTomas Pärt
dc.date.accessioned2021-12-07T07:26:07Z
dc.date.available2021-12-07T07:26:07Z
dc.date.issued2021-07-06T17:21:20.115758Z
dc.descriptionStudien utfördes för att undersöka förekomstmönster av fisk och groddjur i våtmarker anlagda för biologisk mångfald. Undersökningsområdet omfattade anlagda våtmarker i Uppland, Sverige. Data innehåller beskrivande miljövariabler: andel skog inom 1 km radie, våtmarkens storlek, andel vattenvegetation (t.ex. vass, kaveldun), area omgivande mark som översvämmas, anläggningsår, anslutning till andra vatten via vattendrag. Förekomstdata på fisk- och groddjursarter erhölls via vattenprov och eDNA analys. Här anges bara förekomst/icke förekomst av respektive art.sv_SE
dc.descriptionData: Datat innehåller förekomstdata av fiskar och groddjur i anlagda våtmarker i Uppland. Beskrivning av datainsamling: Förekomst av olika arter fisk och groddjur i 52 anlagda våtmarker för biologisk mångfald i Sverige bestämdes genom att via vattenprover analysera rester av DNA i vattnet (sk. eDNA) för identifiering av arter. Det utfördes i juni och juli 2018. Variablerna finns beskrivna i detalj i dokumentationsfilen Ytterligare en datafil med geografiska koordinater för varje våtmark kan hittas i länkad dataförvaring, där ”Site ID” kan användas som en allmän markör för respektive våtmark. En rådatafil, inkluderande antal läsningar DNA, kan fås vid förfrågan.sv_SE
dc.descriptionThe conducted study was done to determine the fish and amphibian occurrence patterns in created wetlands for biodiversity. The geographical study units were individual wetlands in Uppland, Sweden. For each wetland, the data contains all environmental variables considered and estimated within the study: Landscape forest within 1 km buffer, Size, Water vegetation, Flooded area, Year of creation, Connectivity to other wetlands. The data of amphibians and fish were obtained using environmental DNA metabarcoding, where a number of sequences were obtained. We report only whether the species eDNA was detected in a wetland or not (1/0).en_EN
dc.descriptionData: data contains fish and amphibian occurrence data in created wetlands in Uppland, Sweden. Data collection description: Fish and amphibian occurrence in 52 created biodiversity wetlands in Sweden determined by using environmental DNA metabarcoding from water samples. This took place during June and July year 2018. The variables are described in detail in the documentation file. A file with geographical coordinates for the wetlands can be found in the linked data repository, where Site_ID could be used as a common identifier. A raw data file including the number of DNA reads can be provided upon request.en_EN
dc.description.sponsorshipFORMASsv_SE
dc.description.sponsorshipBelmont Forum and BiodivERsAsv_SE
dc.description.sponsorshipStiftelsen Oscar och Lili Lamms Minnesv_SE
dc.description.sponsorshipNaturvårdsverketsv_SE
dc.description.sponsorshipFORMASen_EN
dc.description.sponsorshipBelmont Forum and BiodivERsAen_EN
dc.description.sponsorshipOscar and Lili Lamm Memorial Foundationen_EN
dc.description.sponsorshipSwedish environmental protection agencyen_EN
dc.description.version1
dc.identifier.govdocSLU.ekol.2021.4.4.IÄ-3
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.5878/1277-nk52
dc.identifier.urihttps://archive-harvest.slu.se:8443/jspui/handle/20.500.12703/3912
dc.language.isosv_SEsv_SE
dc.language.isoen_ENen_EN
dc.publisherSveriges lantbruksuniversitet, Sveriges lantbruksuniversitet, Institutionen för ekologisv_SE
dc.publisherSwedish University of Agricultural Sciences, Swedish University of Agricultural Sciences, Department of Ecology, Landscape Ecology Uniten_EN
dc.subjectamfibiersv_SE
dc.subjectdammsv_SE
dc.subjectvåtmarksekosystemsv_SE
dc.subjectfisksv_SE
dc.subjectorganismersv_SE
dc.subjectamphibianen_EN
dc.subjectponden_EN
dc.subjectwetlands ecosystemen_EN
dc.subjectfishen_EN
dc.subjectanimalsen_EN
dc.subjectorganismen_EN
dc.subjectentityen_EN
dc.subjectobject of interesten_EN
dc.titleEnvironmental DNA metabarcoding elucidates patterns of fish colonisation and co-occurrences with amphibians in temperate wetlands created for biodiversitysv_SE
dc.titleEnvironmental DNA metabarcoding elucidates patterns of fish colonisation and co-occurrences with amphibians in temperate wetlands created for biodiversityen_EN
dc.typedatasetsv_SE
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
eDNA_fish_amphibians_created_wetlands_explanations.csv
Size:
2.94 KB
Format:
Unknown data format
Description:
Download
Thumbnail Image
Name:
eDNA_fish_amphibians_created_wetlands_data.csv
Size:
5.6 KB
Format:
Unknown data format
Description:
Download
Thumbnail Image
Name:
2021-188.json
Size:
29.83 KB
Format:
Unknown data format
Description:
Download
Collections
Miljö-DNA metastreckkodning av förekomst av fisk och amfibier i skapade biologiska mångfaldsmarker i Uppland, Sverige