NMR spectra of oilseed rape (Brassica napus) root exudates

Simple item page
dc.contributor.authorElin Alexandersson
dc.contributor.authorHanna Eriksson Röhnisch
dc.contributor.otherAnders Broberg
dc.contributor.otherGustav Nestor
dc.contributor.otherJohan Meijer
dc.contributor.otherCorine Sandström
dc.date.accessioned2025-01-20T09:47:45Z
dc.date.available2025-01-20T09:47:45Z
dc.date.issued2024-02-09T15:35:08.33795Z
dc.descriptionThe dataset contains 1D and 2D NMR spectra of root exudates from various varieties of oilseed rape (Brassica napus). A Bruker Avance III 600 MHz spectrometer connected to Topspin version 3.5 was used to record the spectra. Included are 1D-1H-NOESY, (1H,1H)-TOCSY, (1H,13C)-HSQC, CPMG, and 1D-diffusion spectra of intact root exudates as well as 1D-1H spectra of a sample treated with ultrafiltration and solid phase extraction (SPE), respectively. The dataset further includes spectra from a spike-in experiment where different concentrations of five metabolites were added to a pooled root exudate sample as well as a blank sample. All samples have been freeze-dried and dissolved in D2O. The data was used to develop an automated targeted metabolomics workflow called extended AQuA.en_EN
dc.descriptionDatasetet innehåller 1D- och 2D-NMR-spektra av rotexudat från olika sorters raps (Brassica napus). Spektrumen erhölls med en Bruker Avance III 600 MHz NMR-spektrometer via Topspin version 3.5. För intakta rotexudat finns 1D-1H-NOESY, (1H,1H)-TOCSY, (1H,13C)-HSQC, CPMG- och 1D-diffusionsspektra. I datasetet ingår även 1D-1H-spektra av ett prov som har ultrafiltrerats respektive passerat en SPE-kolonn (fastfasextraktion), samt spektra från ett spikningsexperiment där olika koncentrationer av fem metaboliter satts till både ett poolat rotexudatprov och ett blankprov. Alla prover har frystorkats och sedan lösts upp i D2O. Datan användes för att utveckla "extended AQuA", ett automatiserat arbetsflöde för kvantitativ metabolomik.sv_SE
dc.identifier.govdocSLU.molsci.2023.IÄ.4.4-13
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.5878/8t82-d090
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.5878/4djc-qt25
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12703/5488
dc.languageotheren_EN
dc.publisherSwedish National Data Serviceen_EN
dc.publisherSvensk Nationell Datatjänstsv_SE
dc.subjectOrganic Chemistryen_EN
dc.subjectOrganisk kemisv_SE
dc.subjectAnalytical Chemistryen_EN
dc.subjectAnalytisk kemisv_SE
dc.subjectChemical Sciencesen_EN
dc.subjectKemisv_SE
dc.subjectNatural Sciencesen_EN
dc.subjectNaturvetenskapsv_SE
dc.subjectspectroscopyen_EN
dc.subjectspektroskopisv_SE
dc.subjectoil plantsen_EN
dc.subjectoljeväxtersv_SE
dc.subjectorganic compoundsen_EN
dc.subjectorganiska föreningarsv_SE
dc.subjectBrassicaceaeen_EN
dc.subjectkorsblommiga växtersv_SE
dc.subjectDicotyledonsen_EN
dc.subjecttvåhjärtbladiga växtersv_SE
dc.subjectedible plantsen_EN
dc.subjectnäringsväxtersv_SE
dc.subjectchemical compoundsen_EN
dc.subjectkemiska föreningarsv_SE
dc.subjectchemical analysisen_EN
dc.subjectkemisk analyssv_SE
dc.subjectuseful plantsen_EN
dc.subjectnyttoväxtersv_SE
dc.subjectmatteren_EN
dc.subjectmateriasv_SE
dc.subjectangiospermsen_EN
dc.subjectgömfröiga växtersv_SE
dc.subjectmethods of analysisen_EN
dc.subjectanalysmetodersv_SE
dc.subjectmethodsen_EN
dc.subjectmetodersv_SE
dc.subjectphysical objectsen_EN
dc.subjectfysiska objektsv_SE
dc.subjectplantsen_EN
dc.subjectväxtersv_SE
dc.subjectseed plantsen_EN
dc.subjectfröväxtersv_SE
dc.subjectsocietal objectsen_EN
dc.subjectsamhälleliga objektsv_SE
dc.subjectobjectsen_EN
dc.subjectentitetersv_SE
dc.subjecteukaryoteen_EN
dc.subjecteukaryotersv_SE
dc.subjectvascular plantsen_EN
dc.subjectkärlväxtersv_SE
dc.subjectabstract objectsen_EN
dc.subjectabstrakta objektsv_SE
dc.subjectorganismsen_EN
dc.subjectorganismersv_SE
dc.subjectorganic objectsen_EN
dc.subjectorganiska objektsv_SE
dc.titleNMR spectra of oilseed rape (Brassica napus) root exudatesen_EN
dc.titleNMR-spektra av rotexudat från raps (Brassica napus)sv_SE
dc.typeDatasetsv_SE
Files
Original bundle
Now showing 1 - 7 of 7
Thumbnail Image
Name:
NMR_spectra.zip
Size:
18.29 MB
Format:
Unknown data format
Description:
Download
Thumbnail Image
Name:
Seedlings_1.jpg
Size:
7.35 MB
Format:
Joint Photographic Experts Group/JPEG File Interchange Format (JFIF)
Description:
Download
Thumbnail Image
Name:
Seedlings_2.jpg
Size:
7.25 MB
Format:
Joint Photographic Experts Group/JPEG File Interchange Format (JFIF)
Description:
Download
Thumbnail Image
Name:
Thumbs.db
Size:
16.5 KB
Format:
Unknown data format
Description:
Download
Thumbnail Image
Name:
Alexandersson-E-et-al-2024.pdf
Size:
2.75 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Download
Thumbnail Image
Name:
README.txt
Size:
4.36 KB
Format:
Plain Text
Description:
Download
Thumbnail Image
Name:
2023-258-json-ld.json
Size:
11.44 KB
Format:
Unknown data format
Description:
Download
Collections
NMR spectra of oilseed rape (Brassica napus) root exudates